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<!DOCTYPE html>

</head>

</header>

</div>

<th colspan="2" class="hintergrundfarbe6" style="font-size:105%; text-align:center;">NAMD

</th></tr>

<tr>

<th colspan="2" class="hintergrundfarbe5" style="font-size:105%; text-align:center;">Basisdaten

</p>

</th></tr>

<tr>

<td><b><a href="Softwareentwickler" title="Softwareentwickler">Entwickler</a></b>

</td>

<td>Kooperationsprojekt an der <a href="University_of_Illinois_at_Urbana-Champaign" title="University of Illinois at Urbana-Champaign">University of Illinois at Urbana-Champaign</a>

</td></tr>

<tr>

<td><b>Erscheinungsjahr</b>

</td>

<td>1995

</td></tr>

<tr>

<td><b>Aktuelle <a href="Version_(Software)" title="Version (Software)">Version</a></b>

</td>

<td>3.0<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> <br> (14. Juni 2024)

</td></tr>

<tr>

<td><b><a href="Betriebssystem" title="Betriebssystem">Betriebssystem</a></b>

</td>

<td><a href="Windows" class="mw-redirect" title="Windows">Windows</a>, <a href="MacOS" title="MacOS">macOS</a>, <a href="Linux" title="Linux">Linux</a><sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</td></tr>

<tr>

<td><b><a href="Programmiersprache" title="Programmiersprache">Programmiersprache</a></b>

</td>

</td></tr>

<tr>

<td><b>Kategorie</b>

</td>

<td>Simulationssoftware

</td></tr>

<tr>

<td><b>Lizenz</b>

</td>

<td><a href="Propriet%C3%A4re_Software" title="Proprietäre Software">proprietär</a>

</td></tr>

<tr>

<td><b><a href="Lokalisierung_(Softwareentwicklung)" title="Lokalisierung (Softwareentwicklung)">deutschsprachig</a></b>

</td>

<td>nein

</td></tr>

<tr>

<td class="hintergrundfarbe5" colspan="2" style="text-align:center;"><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/">www.ks.uiuc.edu/Research/namd</a>

</td></tr></tbody></table>

<p><b>NAMD</b> (<i><b>Na</b>noscale <b>M</b>olecular <b>D</b>ynamics program</i>)<sup id="cite_ref-pmid16222654_3-0" class="reference"><a href="#cite_note-pmid16222654-3"><span class="cite-bracket">[</span>3<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> ist ein Programm zur Simulation <a href="Molek%C3%BCldynamik" class="mw-redirect" title="Moleküldynamik">molekulardynamischer</a> Prozesse, das an der <a href="University_of_Illinois_at_Urbana-Champaign" title="University of Illinois at Urbana-Champaign">University of Illinois at Urbana-Champaign</a> als Kooperationsprojekt zwischen der Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) und dem Parallel Programming Laboratory (PPL) entwickelt wird. Eine Besonderheit von NAMD ist das zugrunde liegende parallele Programmiermodell <a href="Charm%2B%2B" title="Charm++">Charm++</a>, das vom Parallel Programming Laboratory (PPL) entwickelt wird und NAMD eine Skalierung bis zu mehreren zehntausend <a href="Prozessor" title="Prozessor">Prozessoren</a> erlaubt.

</p><p>NAMD wurde vom Biophysiker <a href="Klaus_Schulten" title="Klaus Schulten">Klaus Schulten</a> und den Informatikern Robert Skeel und <a href="Laxmikant_V._Kale" class="mw-redirect" title="Laxmikant V. Kale">Laxmikant V. Kale</a> entwickelt.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Unterstützte_Kraftfelder"><span id="Unterst.C3.BCtzte_Kraftfelder"></span>Unterstützte Kraftfelder</h2></div>

<p>NAMD selbst bringt im Gegensatz zu <a href="GROMACS" title="GROMACS">GROMACS</a>, AMBER oder <a href="CHARMM" title="CHARMM">CHARMM</a> kein eigenes Kraftfeld mit. Jedoch werden die Kraftfelder der genannten drei Softwarepakete unterstützt und können für Simulationsläufe relativ einfach eingebunden werden. Als Standardkraftfelder dient NAMD dabei das CHARMM-Kraftfeld, wobei alle Versionen unterstützt werden. Die Kompatibilität zu mehreren Kraftfeldern erlaubt es, ein weit größeres Feld an Molekülen berechnen zu können als mit einem einzigen Kraftfeld möglich wäre, da nicht in jedem Kraftfeld immer dieselben Moleküle parametrisiert sind.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/">Offizielle Website</a> (<a href="Englische_Sprache" title="Englische Sprache">englisch</a>)</li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text"><span class="cite"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/3.0/announce.html"><i>NAMNAMD 3.0 Announcement.</i></a><span class="Abrufdatum"> Abgerufen am 21. Juni 2024</span> (englisch).</span><span style="display: none;" class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Adc&rfr_id=info%3Asid%2Fde.wikipedia.org%3ANAMD&rft.title=NAMNAMD+3.0+Announcement&rft.description=NAMNAMD+3.0+Announcement&rft.identifier=https%3A%2F%2Fwww.ks.uiuc.edu%2FResearch%2Fnamd%2F3.0%2Fannounce.html&rft.language=en"> </span></span>

</li>

<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text"><span class="cite"><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ks.uiuc.edu/Development/Download/download.cgi?PackageName=NAMD"><i>Software Downloads: Version 2.12 (2016-12-22) Platforms.</i></a><span class="Abrufdatum"> Abgerufen am 16. Januar 2017</span> (englisch).</span><span style="display: none;" class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Adc&rfr_id=info%3Asid%2Fde.wikipedia.org%3ANAMD&rft.title=Software+Downloads%3A+Version+2.12+%282016-12-22%29+Platforms&rft.description=Software+Downloads%3A+Version+2.12+%282016-12-22%29+Platforms&rft.identifier=http%3A%2F%2Fwww.ks.uiuc.edu%2FDevelopment%2FDownload%2Fdownload.cgi%3FPackageName%3DNAMD&rft.language=en"> </span></span>

</li>

<li id="cite_note-pmid16222654-3"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-pmid16222654_3-0">↑</a></span> <span class="reference-text">James C. Phillips, Rosemary Braun, Wei Wang, James Gumbart, Emad Tajkhorshid, Elizabeth Villa, Christophe Chipot, Robert D. Skeel, Laxmikant Kalé, Klaus Schulten: <cite style="font-style:italic">Scalable molecular dynamics with NAMD</cite>. In: <cite style="font-style:italic">J Comput Chem</cite>. <span style="white-space:nowrap">Band<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>26</span>, <span style="white-space:nowrap">Nr.<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>16</span>, 2005, <span style="white-space:nowrap">S.<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>1781–1802</span>, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1002/jcc.20289">10.1002/jcc.20289</a></span>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16222654?dopt=Abstract">PMID 16222654</a>.<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rfr_id=info:sid/de.wikipedia.org:NAMD&rft.atitle=Scalable+molecular+dynamics+with+NAMD&rft.au=James+C.+Phillips%2C+Rosemary+Braun%2C+Wei+Wang%2C+...&rft.date=2005&rft.doi=10.1002%2Fjcc.20289&rft.genre=journal&rft.issue=16&rft.jtitle=J+Comput+Chem&rft.pages=1781-1802&rft.pmid=16222654&rft.volume=26" style="display:none"> </span></span>

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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